夫妻离婚时公司财产的分割需要根据具体情况采取不同的方法。以下是几种可能的处理方式：
直接分割股权
如果夫妻双方都有经营能力且愿意继续共同经营公司，可以根据《民法典》第一千零八十七条的规定，直接分割公司的股权比例。
解散公司并进行清算
如果夫妻双方都要求解散公司并进行清算，可以在清算后对公司剩余财产根据《民法典》的相关规定进行分割。
股权转让给第三人
夫妻一方要求保留公司，另一方要求退出公司并获得相应补偿的，可以考虑将股权部分转让给第三人。这样既能保障退出一方的补偿，又能使公司继续存续。若没有第三人愿意受让部分股权，可以根据一人有限责任公司的特别规定，由一方给付另一方退出公司的相应补偿，将有限责任公司依法变更为一人有限责任公司。
竞价决定经营主体
夫妻双方都要求独自经营公司的情况下，可以采取竞价的方式决定经营主体，并对另一方进行相应补偿。
财产评估与区分
在进行财产分割前，需要明确公司的性质与股权结构，并进行财产评估。评估结果将作为财产分割的重要依据。同时，需要区分婚前婚后财产，婚前财产原则上归一方所有，婚后增值部分则需根据夫妻双方在公司的经营贡献等因素综合判断分配比例。
协商与调解
夫妻双方应尽量通过友好协商的方式解决公司财产分配问题。可以借助律师、婚姻家庭咨询师等专业人士的力量，制定双方都能接受的分配方案。若协商不成，可申请法院调解，法院会综合考虑各种因素，尽力促成双方达成调解协议。
法院判决
若协商与调解均无果，法院将依据相关法律规定进行判决。法院会审查夫妻双方在公司的出资情况、经营贡献、婚姻过错等因素，按照公平原则对公司财产进行分割。例如，如果一方在婚姻期间存在过错，如重婚、与他人同居、家庭暴力等，法院在分割财产时会适当倾向于无过错方。
综上所述，夫妻离婚时公司财产的分割方法多样，具体操作时可以根据实际情况选择最合适的方式，并在必要时寻求专业法律人士的帮助。