医保与农村合作医疗（新农合）的区别主要体现在以下几个方面：
参保对象
农村合作医疗：主要针对农村人口，特别是没有在城镇务工的农民。
医保：包括城镇职工基本医疗保险和城镇居民基本医疗保险，主要针对城市居民及企业职工。
缴费标准
农村合作医疗：缴费标准相对较低，每年固定金额，且政府会提供一定的补贴。
医保：缴费标准与个人工资及当地平均工资挂钩，分为职工医保和居民医保，单位与个人共同缴纳。
报销比例和范围
农村合作医疗：报销比例较低，报销范围主要集中在住院费用，且不同级别的医院报销比例有所不同。
医保：报销比例较高，覆盖范围更广，包括门诊、住院及特殊药品和治疗费用，且在大医院的报销比例相对较高。
缴费方式
农村合作医疗：农民自愿参加，一年缴费一次。
医保：由单位和个人共同缴纳，按月缴纳。
待遇与退休政策
农村合作医疗：没有退休政策，需要终身缴费。
医保：在达到退休年龄并满足一定缴费年限后，可以享受终身医保待遇。
包含项目
农村合作医疗：主要包含医疗保险。
医保：除了医疗保险外，还可能包含养老保险、失业保险、工伤保险和生育保险。
管理与覆盖人群
农村合作医疗：通常由卫生部门管理，覆盖农村户口居民。
医保：由人力资源和社会保障部门管理，覆盖工人、农民、城镇居民等各类劳动者。
综上所述，医保与农村合作医疗在参保对象、缴费标准、报销比例和范围、缴费方式、待遇与退休政策、包含项目以及管理与覆盖人群等方面存在明显的区别。选择哪种医疗保险制度，取决于个人所居住的地域、就业状况以及经济条件。