南通市拥有众多知名企业和工厂，以下是一些主要的公司：
南通中远集团有限公司：
中国最大的航运物流企业之一，主要从事航运、港口运营和国际贸易等业务。
南通金陵汽车集团有限公司：
专业从事汽车制造和销售的大型企业，旗下拥有金陵汽车、荣威汽车等知名品牌。
南通振东集团有限公司：
在纺织、化工、石化等领域具有较强实力，是中国新型纤维材料行业的龙头企业之一。
南通扬子石化有限公司：
主要从事石化产品的研发、生产和销售，是中国重要的石油化工企业之一。
南通科技投资集团股份有限公司：
1994年在上海证券交易所上市，标志着南通企业正式踏上资本市场的舞台。
南通建工集团股份有限公司：
前身最早为“南通市营建筑公司”，成立于1952年4月，是江苏乃至全国成立最早的建筑公司之一，具有国家房屋建筑工程施工总承包特级资质等多项资质。
南通万德科技有限公司：
新加坡独资企业，成立于2006年8月，主要从事电子设备、电子模组的结构件、外观件的配套设计和生产。
南通轨道交通集团有限公司：
成立于2016年12月19日，从事交通运输、仓储和邮政业。
南通中集集装箱有限公司：
隶属于世界500强企业招商局集团，是世界上最大的集装箱生产企业之一。
南亚南通基地：
由世界500强企业台塑集团投资设立，专业生产PVC、PU产品、高低压配电盘等。
上海振华重工南通分公司：
隶属于世界500强企业中国交通建筑股份公司，从事港口机械设备的生产。
万达轴承：
国内叉车轴承行业的领军企业，2024年上半年成功登陆北京证券交易所。
中天科技集团：
2024年营业收入突破千亿元，成为南通首个千亿级制造业企业。
这些公司在各自的领域内都有显著的影响力，推动了南通市乃至江苏省的经济发展。