厦门房子过户费用的计算方法如下：
个人所得税
5年内的房屋过户，卖方需缴纳个人所得税，税率为房屋转让收入的20%。
5年以上的房屋过户，免征个人所得税。
契税
90平方米以下首次购房的契税按1%缴纳。
90-140平方米的契税按房价的1.5%缴纳。
140平方米以上的契税按房价的3%缴纳。
印花税
印花税按房屋转让合同金额的0.05%征收，买卖双方各承担一半。
房屋交易手续费
每平方米5元，买卖双方各承担一半。
房屋评估费
按评估后总价的0.5%收取。
公证费
最高300元。
房产证工本费
普通住宅类型的房屋80元一本，非普通住宅类型的房屋每套550元。
其他费用
如房屋面积大于144平方米且持有满五年，需征收增值部分营业税。
土地出让金、所得收益缴纳等（仅适用于经济适用住房）。
建议
买方：主要需缴纳契税、印花税、房屋交易手续费和房产证工本费。
卖方：需缴纳个人所得税（如适用）、契税（如适用）、印花税、房屋交易手续费、房屋评估费和公证费。
建议在办理房屋过户时，详细咨询当地房产交易中心或中介机构，以确保准确了解所有相关费用。