公章不在公司可能有以下原因：
存放于安全地点：
公司通常会将公章存放在安全的地方，如保险柜中，并由专门的人员负责保管和使用，以确保其安全。
专人负责：
公章应由专人负责保管，并且在使用前需要进行严格的审核和审批，确保只有经过授权的人员才能使用。
特殊情况：
在特殊情况下，公章可能会临时携带外出办事，但应加强保护，并在事情办完后立即交回。
法律允许：
虽然我国法律没有明确规定公章由谁来保管，这属于公司自治范围，由公司股东会决议决定。
防止丢失或盗用：
公章是公司的重要财务凭证，一旦丢失或被盗用，可能会造成严重的财务损失，因此公司会采取措施保护其安全。
所有权争议：
有时，法定代表人被罢免后可能会带走公司公章，导致公司与法定代表人之间发生公章所有权的争议。
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