分居满两年可以选择以下两种方式离婚：
协议离婚
双方需签订书面离婚协议，明确子女抚养、财产及债务处理等事项。
携带身份证、户口本、结婚证、离婚协议到婚姻登记机关申请离婚登记。
需经历30天冷静期后，双方再次前往婚姻登记机关领取离婚证。
诉讼离婚
一方向法院提交离婚起诉书及相关证据，如分居协议、租赁合同、往来信函、居委会证明等。
法院会进行调解，若调解无效且分居满两年，确认感情破裂，判决准予离婚。
建议
协议离婚：双方若能够协商一致，这是最为快速和平的离婚方式。需要确保所有协议内容明确、合法，并避免在冷静期内出现反悔。
诉讼离婚：若一方不同意离婚或协商无果，另一方可以向法院提起诉讼。在诉讼过程中，需要提供充分的证据证明分居满两年，并且感情确已破裂。建议聘请律师协助处理相关手续和证据，以增加胜诉的可能性。
无论选择哪种方式，都应遵循法律程序，确保公正合法。