社保的扣除主要通过以下两种方式进行：
单位代扣代缴
个人缴费部分和单位缴费部分：在缴纳社保时，个人需要承担的部分和单位需要承担的部分需要一并缴纳，不能只缴纳其中一方。
缴费比例：例如，养老保险个人缴纳8%，单位缴纳20%；医疗保险个人缴纳2%，单位缴纳10%等。
个人由银行代扣
办理银行代扣业务：需要到当地社保局办理银行代扣业务，每个月往银行卡存钱，银行会直接扣款。
注意事项：
如果连续三个月未能划款成功，将停止缴费人的社会保险缴费业务。若要结算所欠社保费，应到所属街道社保管理站个人缴费窗口重新申请划扣。
个人承担的社保费用需要计入工资薪金并申报个税，但是属于专项扣除又从工资薪金中扣除了。
企业和个人在社保扣除中的责任：
企业：需要自行申报并按时足额缴纳社会保险费，包括企业部分和个人部分，并且需要将缴纳社会保险费的明细情况告知员工。
个人：需要按照规定的比例缴纳个人部分的社保费用，并且可以通过银行代扣的方式进行缴纳。
通过以上步骤和注意事项，可以确保社保费用的正确扣除和缴纳。