物流公司需要缴纳的税收主要包括以下几种：
增值税（Value Added Tax, VAT）
税率：一般纳税人11%，小规模纳税人3%。
包含服务：陆路、水路、航空、管道运输服务，仓储、配送及货运代理等。
企业所得税
税率：一般25%，符合条件的小型微利企业减按20%，国家重点扶持的高新技术企业减按15%。
个人所得税
对企业员工工资薪金等收入征收。
城市维护建设税
税率：市区7%，县、镇5%，其他地区1%。
教育费附加和地方教育附加
税率：教育费附加3%，地方教育费附加2%。
印花税
对合同、凭证等征收，税率根据合同类型不同而有所差异。
房产税
对企业自有房产征收。
土地增值税
对出售房产时产生的增值部分征收。
车辆购置税
对企业购置车辆时征收。
其他税费
包括车船税、土地使用税、水利建设税等。
物流公司还需注意申报如工公经费、社保、公积金、残保金等其他费用。
以上信息根据最新的税法规定和发布时间整理得出，具体税率和计算方法可能因地区和政策更新而有所变化，请咨询当地税务部门或专业税务顾问以获得最准确的信息